No Brasil, a pesar dos avanços de mais de 30 anos no controle vetorial, a doença de Chagas continua sendo um problema persistente em saúde pública. Dados oficiais estimam que ela afeta entre 1 a 3 milhões de pessoas, representando entre 1,0 e 2,4% da população nacional. O país também tem uma elevada carga de mortalidade por doença de Chagas, sendo uma das quatro principais causas de morte por doenças infecciosas e parasitárias.

Entre 2010 e 2019, foram registrados casos agudos na maioria dos estados brasileiros. A região Norte teve a maior prevalência, com 84% desses casos. CUIDA Chagas atuará em municípios disptribuídos em cinco estados das macrorregiões brasileiras (Norte, Nordeste, Centro-Oeste, Sudeste e Sul). Os municípios foram selecionados pelo Ministério da Saúde de acordo com as prioridades da saúde pública e considerando diversidade geográfica e epidemiológica.